Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ell2Q3UKU1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms