Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Usp19Q3UJD6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Usp19Q3UJD6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp19Q3UJD6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Usp19Q3UJD6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Usp19Q3UJD6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Usp19Q3UJD6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Usp19Q3UJD6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Usp19Q3UJD6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Usp19Q3UJD6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Usp19Q3UJD6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Usp19Q3UJD6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Usp19Q3UJD6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Usp19Q3UJD6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Usp19Q3UJD6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp19Q3UJD6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms