Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sf3b2Q3UJB0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms