Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc34Q3UI66 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc34Q3UI66 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms