Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmod2Q3UHZ5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmod2Q3UHZ5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms