Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Greb1Q3UHK3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Greb1Q3UHK3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms