Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arfgef3Q3UGY8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms