Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc58Q3UGP9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc58Q3UGP9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms