Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGM2

Nek10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek10Q3UGM2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek10Q3UGM2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms