Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Garem1Q3UFT3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Garem1Q3UFT3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms