Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zyg11bQ3UFS0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zyg11bQ3UFS0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms