Protein–RNA interactions for Protein: Q3UE17

Mex3d, RNA-binding protein MEX3D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3dQ3UE17 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mex3dQ3UE17 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mex3dQ3UE17 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mex3dQ3UE17 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mex3dQ3UE17 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mex3dQ3UE17 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mex3dQ3UE17 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mex3dQ3UE17 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mex3dQ3UE17 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mex3dQ3UE17 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mex3dQ3UE17 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mex3dQ3UE17 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mex3dQ3UE17 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mex3dQ3UE17 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mex3dQ3UE17 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mex3dQ3UE17 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mex3dQ3UE17 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mex3dQ3UE17 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mex3dQ3UE17 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mex3dQ3UE17 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mex3dQ3UE17 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mex3dQ3UE17 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms