Protein–RNA interactions for Protein: Q3UC65

Rsrp1, Arginine/serine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsrp1Q3UC65 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsrp1Q3UC65 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsrp1Q3UC65 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsrp1Q3UC65 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rsrp1Q3UC65 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms