Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cops9Q3U898 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cops9Q3U898 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Cops9Q3U898 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Cops9Q3U898 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Cops9Q3U898 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cops9Q3U898 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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