Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Gtpbp6Q3U6U5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp6Q3U6U5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms