Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf149Q3U2C5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms