Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorlQ3U285 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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