Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Serac1Q3U213 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Serac1Q3U213 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Serac1Q3U213 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Serac1Q3U213 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Serac1Q3U213 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Serac1Q3U213 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Serac1Q3U213 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Serac1Q3U213 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Serac1Q3U213 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Serac1Q3U213 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Serac1Q3U213 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Serac1Q3U213 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Serac1Q3U213 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Serac1Q3U213 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Serac1Q3U213 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Serac1Q3U213 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Serac1Q3U213 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Serac1Q3U213 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Serac1Q3U213 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Serac1Q3U213 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms