Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q3U1D9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U1D9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U1D9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U1D9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Q3U1D9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U1D9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Q3U1D9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U1D9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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