Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc9Q3U0M1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms