Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hace1Q3U0D9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms