Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atp13a5Q3TYU2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms