Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc136Q3TVA9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc136Q3TVA9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms