Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q3TTJ4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms