Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Calr4Q3TQS0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calr4Q3TQS0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms