Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q3TQQ9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q3TQQ9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms