Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Smarca4Q3TKT4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarca4Q3TKT4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca4Q3TKT4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms