Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdss2Q33DR3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdss2Q33DR3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms