Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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H2-M3Q31093 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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H2-M3Q31093 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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H2-M3Q31093 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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H2-M3Q31093 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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H2-M3Q31093 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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H2-M3Q31093 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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H2-M3Q31093 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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H2-M3Q31093 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-M3Q31093 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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H2-M3Q31093 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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H2-M3Q31093 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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H2-M3Q31093 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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H2-M3Q31093 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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H2-M3Q31093 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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H2-M3Q31093 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-M3Q31093 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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