Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
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Shroom4Q1W617 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
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Shroom4Q1W617 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Shroom4Q1W617 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shroom4Q1W617 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shroom4Q1W617 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shroom4Q1W617 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shroom4Q1W617 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Shroom4Q1W617 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shroom4Q1W617 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shroom4Q1W617 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shroom4Q1W617 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shroom4Q1W617 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Shroom4Q1W617 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
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Shroom4Q1W617 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
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