Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cpne9Q1RLL3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne9Q1RLL3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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