Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms