Protein–RNA interactions for Protein: Q14C37

Lemd1, LEM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd1Q14C37 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lemd1Q14C37 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lemd1Q14C37 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lemd1Q14C37 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lemd1Q14C37 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lemd1Q14C37 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lemd1Q14C37 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lemd1Q14C37 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lemd1Q14C37 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lemd1Q14C37 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lemd1Q14C37 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lemd1Q14C37 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lemd1Q14C37 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lemd1Q14C37 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lemd1Q14C37 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lemd1Q14C37 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lemd1Q14C37 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lemd1Q14C37 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lemd1Q14C37 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lemd1Q14C37 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lemd1Q14C37 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lemd1Q14C37 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms