Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gli2Q0VGT2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gli2Q0VGT2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms