Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp2b3Q0VF55 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2b3Q0VF55 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms