Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cpne7Q0VE82 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms