Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rundc1Q0VDN7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms