Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vps8Q0P5W1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Vps8Q0P5W1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps8Q0P5W1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms