Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc45a4Q0P5V9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc45a4Q0P5V9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms