Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnnm1Q0GA42 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cnnm1Q0GA42 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cnnm1Q0GA42 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnnm1Q0GA42 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnnm1Q0GA42 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnnm1Q0GA42 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnnm1Q0GA42 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnnm1Q0GA42 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnnm1Q0GA42 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnnm1Q0GA42 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnnm1Q0GA42 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnnm1Q0GA42 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnnm1Q0GA42 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnnm1Q0GA42 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnnm1Q0GA42 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnnm1Q0GA42 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnnm1Q0GA42 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms