Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700061G19RikQ08EE8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700061G19RikQ08EE8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms