Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ssrp1Q08943 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms