Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc4Q08624 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc4Q08624 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms