Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Calb2Q08331 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms