Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rad51Q08297 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad51Q08297 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad51Q08297 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad51Q08297 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad51Q08297 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad51Q08297 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad51Q08297 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rad51Q08297 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms