Protein–RNA interactions for Protein: Q08288

Lyar, Cell growth-regulating nucleolar protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LyarQ08288 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LyarQ08288 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LyarQ08288 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LyarQ08288 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LyarQ08288 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms