Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ebf1Q07802 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms