Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MestQ07646 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MestQ07646 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MestQ07646 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MestQ07646 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MestQ07646 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MestQ07646 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MestQ07646 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MestQ07646 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
MestQ07646 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MestQ07646 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MestQ07646 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MestQ07646 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MestQ07646 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MestQ07646 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MestQ07646 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MestQ07646 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MestQ07646 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MestQ07646 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MestQ07646 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MestQ07646 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MestQ07646 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MestQ07646 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MestQ07646 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MestQ07646 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MestQ07646 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MestQ07646 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MestQ07646 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MestQ07646 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MestQ07646 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MestQ07646 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MestQ07646 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MestQ07646 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MestQ07646 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MestQ07646 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MestQ07646 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MestQ07646 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MestQ07646 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MestQ07646 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MestQ07646 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MestQ07646 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MestQ07646 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MestQ07646 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MestQ07646 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MestQ07646 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MestQ07646 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MestQ07646 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MestQ07646 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MestQ07646 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MestQ07646 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MestQ07646 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MestQ07646 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MestQ07646 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MestQ07646 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MestQ07646 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MestQ07646 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MestQ07646 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MestQ07646 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MestQ07646 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MestQ07646 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MestQ07646 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MestQ07646 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MestQ07646 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MestQ07646 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MestQ07646 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MestQ07646 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MestQ07646 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MestQ07646 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MestQ07646 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms