Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col9a2Q07643 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col9a2Q07643 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms