Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntn3Q07409 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cntn3Q07409 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms